Sci Adv:很难证据支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的存在

2022-01-31 01:47:06 来源:
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导言:在早期阶段性,自然界就开始了在不扭转大肠杆菌细胞会DNA组织起来左至右的前提下来使其DNA发挥作用各不大致相同的功能,而这就是通过给DNA亚基上加到工程学上标来充分利用的。DNA羧酸化是灵长目的关键表型遗传机制,其里5-羧酸胞嘧啶(5mc)是最常见的DNA词句之一。6mdA是大肠杆菌限制病态词句系统的大体组成成分,现今在灵长目里缺乏已确定的限制病态词句系统。先前有不少研究成果美联社,6mdA也不存在于灵长目里,但并无事实支持。

已对,在《社会科学进展》上的一项研究成果里,瑞典林雪平大学的研究成果管理人员暗示,灵长目细胞会里不存在大肠杆菌表型遗传上标很可能被废水了,并且很难足够的事实来证明了灵长目里不存在这种词句。

N6-羧酸腺嘌呤(6mdA)是大肠杆菌里广泛的DNA词句,但最近在灵长目DNA里也得到了比如说。然而,研究成果管理人员曾说,即使对来自大致相同灵长目细胞会各种类型的DNA进行的6mdA都可和丰度测量研究成果也不赞同。

为了进一步阐明6mdA在灵长目后代尺寸里的作用,研究成果管理人员利用了体内将人类无聊T来进行(NTH)细胞会分化为TH细胞会亚群的能力。但是,与先前的研究成果相反,他们推测TH分化过程里6mdA的丰度很难全局变化,并且判读到分化的T细胞会里的6mdA水准与未能羧酸化的全线粒体扩充DNA大致相同,这暗示6mdA并未能以可检验的水准不存在人类T细胞会里。

他们还研究了从六个人类细胞会系里分离出的DNA里的6mdA,并鉴定出两个不具备少于背景阻尼水准的6mdA水准的细胞会系。出乎意料的是,两种原则上的293T细胞会系培育出物不具备各不大致相同的6mdA水准,这暗示研究成果管理人员判读到的6mdA波形并非细胞会各种类型本身固有的。确实,当他们进一步看时,他们推测两条6mdA水准上升的细胞会系被阴性菌归入废水,阴性菌归入一种常见的大肠杆菌细胞会培育出物里矿物质6mdA的二氧化硫。当他们用阴性菌特异病态药物Plasmocin处理细胞会系时,6mdA波形降低为A阴病态对照。

“我们意识到通过这些高效率检验到的6mdA'波形'只是阻尼。但是,由于一些简单的高效率问题,几种新方法里的背景阻尼不是随机的,而是真实波形。”高级著者Colm Nestor(洛德帕·内斯特)在一份回应里话说。

研究成果管理人员研究了直到现在通过DNA免疫沉淀工程学合成、小分子和单分子可视工程学合成在灵长目细胞会里定位或检验6mdA的希望。人们推测每种新方法都有局限病态或缺陷,使表型遗传上标的所谓阳病态推测率很高,似乎暗示林雪平研究成果管理人员认为不不存在这种物理现象的事实。

这组著者曾说:“我们证明了,RNA和大肠杆菌废水、免疫球蛋白交叉反应病态和其他高效率限制的相结合已导致6mdA在灵长目DNA里的连续不断正确识别系统。随着DNA和RNA词句的王室的不断增长,以及直到现在未能知词句的丰富病态更为罕见,即使用于多种两者之间新方法,我们也强调了正确推测的可能病态。我们建议用于词句和未能词句的线粒体DNA标准作为今后对稀有DNA词句的研究成果的最低尽快,以及在用于前更更进一步地检验免疫球蛋白特异病态。”

内斯特补足话说,研究成果管理人员在研究成果十分罕见的物理现象时必须十分小心,选择用于哪种新方法,并再考虑他们是否或许在衡量不存在的事物。他话说:“现在我们可以众所周知地话说灵长目里不不存在6mdA。关于6mdA,如果研究成果管理人员停止研究成果根本不不存在的的路,则可以节省大量整整和有钱人,并且不致了很多令人满意的心里。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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