Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录暂停

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和遗传物质 DNA 组成的特殊脱氧核糖核酸结构上，在原核和真核动物的DNA组当中地理分布国际上且值得注意。R-loop 在很多关键的化学键动物学过程当中造就关键功能，包括核仁省略、DNA表达依赖性、DNA 损坏翻修以及DNA组稳定性等，但其如何被精确依赖性的功能尚能不明了。m6A 省略作为信使 RNA 上丰度最高的省略类型，国际上参与灵长类的发育不良、免疫反应、干细胞膜更新、脂肪分化、以及生成和移转到等生命过程。然而，目前尚能不明了 m6A 是否能作为 R -loop 当中 RNA 溶质的本源特点来依赖性 R -loop 水平，进而造就各种化学键动物学功能。当中科院北平DNA组科学研究所杨运桂、任捷与清华生科院孙前文设计团队共同科学研究，见到 m6A 能稳定 R-loop 的呈现出，进而依赖性DNADNA表达的有效暂时当中止。这一重大突破以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线刊发于《细胞膜科学研究》（Cell Research）杂志。科学研究设计团队首先通过斑点化学键杂交和免疫反应荧光高效率，见到敲低 m6A 甲基移转到酶 METTL3 显着降低 R -loop 水平，且该依赖性作用依赖于 METTL3 甲基移转到酶活性。随后，设计团队的组织为了让高效液相组分共同质谱高效率，见到相比于生殖细胞膜结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 溶质有更加富集的 m6A 省略。实质性为了让基于遗传物质 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链免疫反应共沉淀测序测序高效率（ssDRIP-seq），见到下调的 R -loop 主要富集在DNA表达暂时当中止区域，R-loop 变化程度与 m6A 的距离和省略水平相关。为了探索 m6A 对 R -loop 依赖性的化学键动物学功能，科学研究设计团队绘制了 RNA 聚合酶DNA表达核苷酸的实时图谱，并在 MYC、ACTIN DNA上顺利进行多种DNA表达活性测定，见到 m6A 有利于 R -loop 呈现出是DNA表达暂时当中止阶段的早先，可以能避免 RNA 聚合酶的DNA表达通读。最后，设计团队的组织借助于了针对DNA表达通读的报告DNA系统设计，通过 m6A 省略核苷酸的突变实质性证实 m6A 对于 R -loop 呈现出及DNA表达暂时当中止的关键作用。该科学研究见到了 m6A 磷酸化省略的共DNA表达依赖性功能，揭示了 RNA 磷酸化省略对核仁结构上的影响，以及 R-loop 结构上当中的 RNA 溶质被省略后对其自身稳态的依赖性功能，阐释了 m6A 通过稳定 R-loop 而有利于DNA表达长时间暂时当中止的情形，为实质性科学研究 m6A 与 R-loop 的依赖性功能和相应化学键动物学功能缺少了基本上的高效率和理论支撑。该科学研究取得了学部委员关键性先导新材料专项、发达国家自然科学以及发达国家重点研制计划等基金筹集资金。原始典故：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).