Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞胰脏的预后生物标志物

2021-12-27 02:07:21 来源:
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这项深入研究旨在确定一种可以预报食管鳞状细胞胃癌(ESCC)病患者总体病状(OS)的miRNAs关键字。

从NCBI GEO获得119名ESCC病患者的miRNA表示谱及其相应的临床资讯,并将其作为培训集。在早期和末期样品有数筛选差异表示的miRNAs(DEmiRNAs)。用到Cox重返归纳、递归特征消除(RFE)-背书向量机(SVM)算法和LASSO Cox重返静态来辨别病状普遍性miRNAs,从而建立病状打分静态。此外,预报了这些病状普遍性miRNAs的有前途靶基因序列,然后构建了miRNA靶基因序列局域网。通过基本功能石英砂归纳,归纳了ESCC中这些病状普遍性miRNAs预报靶基因序列的基本功能相关普遍性。

在培训之外,早期与末期样品有46个DEmiRNAs。建立了基于5个miRNAs的效用打分静态。该5-miRNA效用打分可以将培训集分为OS时有数明显不同的高危组和低危组。在一个来自乳腺胃癌基因序列组图谱(TCGA)的单一数据资料之外,取得成功检验了5-miRNA效用打分的效用整体能力。已确定了与这些miRNAs相关的各种生物学过程和路中,例如Wnt信号路中、TRP通道的炎症介质调节路中和雌激素信号路中。

这项深入研究提示,与病理已确定相关的5-miRNA关键字对预报ESCC病患者的病状兼具临床意义。

许多现代出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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