Hepatobiliary Surg Nutr:中国肝癌患者的基因突变基本特征!

2022-02-14 11:56:41 来源:
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肝细胞癌(HCC)是全球第六大最相似乳腺癌,也是第四大最相似的乳腺癌无关被害可能。丙型肝炎肝炎是鼻咽癌的相似可能,而必先却是是肝炎大国,必先有很高的鼻咽癌负担。虽然现在很多研究工作都集之中在鼻咽癌的致病蛋白质特征,但是,之华南地区HCC患儿的遗传研究成果尚未有充分研究工作。

本研究工作旨在解析之华南地区HCC患儿的遗传特征。

共计征募了165位HCC患儿,最主要146位男性和19位女性。之中位年龄为55岁(覆盖范围 27-78岁)。同时采集了患儿的相应的药理学和病因反馈。共计采集了168份组织以顺利进行二代PCR(NGS),涵盖450个蛋白质。验证的基因突变最主要单核苷酸基因突变(SNV)、小短片和长短片嵌入和局限性(InDels)、拷贝数基因突变和蛋白质重组。此外,还研究了凋亡超载(TMB),略低于四分位的HCC被分割为高TMB。

凋亡研究成果

在168份HCC组织之中的258个蛋白质验证出了1004个遗传基因突变。确定了160份HCC样本的TMB值,之中位TMB值为5.4 Muts/Mb(覆盖范围 0-28.4 Muts/Mb),75% TMB线为7.7 Muts/Mb。最相似的凋亡蛋白质有TP53、TERT、CTNNB1、AXIN1、RB1、TSC2、CCND1、ARID1A和FGF19。SNV是最相似的凋亡各种类型,G:C>T:A和鸟嘌呤裂解是最相似的SNV。

与野生型患儿相对,运载TP53凋亡的患儿之中Edmondson III-IV级和肺泡增生的比例明显较高(p<0.05)。在TERT凋亡的患儿之中,侵犯肝外膜的比例明显更高(p<0.05)。在CTNNB1凋亡患儿之中,Edmondson I-II级、甲胎蛋白(AFP) <25 μmg/L和无乙肝病史的比例显著升高(p<0.05)。CTNNB1凋亡与高TMB无关(p

无关研究显示,TP53凋亡与肺泡摧残(p=0.002, OR=3.096)和Edmondson III-IV级独立自主无关(p=0.008, OR=2.613)。TERT凋亡与肝外膜增生独立自主无关(p=0.001, OR=3.030)。CTNNB1凋亡与AFP独立自主无关(

综上所述,之华南地区HCC患儿最相似的凋亡蛋白质有TP53、TERT和CTNNB1,这些蛋白质可能通过抑制TP53通路、Wnt信号通路和DNA修复通路导致HCC的发生发展。而且,运载不同蛋白质凋亡的患儿不一定有不同的药理学特征。

原始出处:

Wang Shuo,Shi Huasheng,Liu Tao et al. Mutation profile and its correlation with clinicopathology in Chinese hepatocellular carcinoma patients. Hepatobiliary Surg Nutr, 2021, 10: 172-179.

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